С терапевтической целью применяются наземные части пустырника в которых содержится большой комплекс полезных активных компонентов:

• Иридоиды (аюгол, аюгозид, галиридозид) и сапонины нормализующие сердечный ритм и оказывающие гипотензивное действие.
• Алкалоиды (стахидрин, леонурин) которые оказывает гипотензивное и седативное действие.
• Флавоноидные гликозиды (рутин, кверцетин, квинквелозид, гиперозид и др.) - обладают капилляр укрепляющей способностью и антиоксидантным действием.
• Холин – защищает нервные клетки от разрушения и улучшает память.
• Дубильные вещества, органические кислоты (яблочная, винная, лимонная) - нормализуют пищеварение. 

В народной и официальной медицине пустырник широко и активно применяется:

• как сердечное средство с отрицательным хронотропным (снижающим частоту сердечных сокращений) и кардиотоническим действием;
• как средство снижения артериального давление при лечении вегетососудистой дистонии по гипертоническому и кардиальному типу
• как прекрасное седативное средство для лечения распространённых расстройств центральной нервной системы, неврозов различного характера, нарушений сна, снижает повышенную возбудимость, помогает при панических атаках;

По характеру действия препараты пустырника близки к препаратам валерианы, но лечебный эффект пустырника развивается довольно медленно, поэтому наиболее целесообразно его комбинирование с другими лекарственными травами аналогичного действия.